ปี พ.ศ. 2509 นายแพทย์วิสุทธิ์ ต่างใจ ได้โอนกิจการโรงเรียนให้กับ นางเพ็ญศรี สิงหเสนีย์ มีนางเรณู บุญครองเขต เป็นผู้จัดการ มีนักเรียนขณะนั้นรวมทั้งสิ้น 75 คน
ปี พ.ศ. 2510 นางเพ็ญศรี สิงหเสนีย์ ได้โอนกิจการให้กับ นางเรณู บุญครองเขต ซึ่งในปีเดียวกันมีนักเรียนเพิ่มขึ้นจากเดิมเป็น 160 คน อาคารเรียนก็เปลี่ยนจากบ้านชั้นเดียวยกพื้น มาเป็นอาคารไม้ ชั้นเดียว 4 ห้องเรียน โดยโรงเรียนต้องชำระค่าเช่าที่ดินเป็นรายเดือนๆ ละ 200 บาท
ปี พ.ศ. 2512 นางเรณู บุญครองเขต ได้ก่อสร้างอาคารเรียนหลังใหม่ ในที่ดิน 2 ไร่ ถนนวงศ์วิวัฒน์ พร้อมได้ยื่นคำร้องขอเปลี่ยนชื่อโรงเรียน จาก “ อินทระวิทยา “ มาเป็น “โรงเรียนบุณยลาภนฤมิต” ซึ่งเป็นชื่อที่พ่อท่านคล้ายวาจาสิทธิ์ แห่งวัดจันดี อำเภอฉวาง จังหวัดนครศรีธรรมราช เป็นผู้ตั้งให้ และได้อยู่ในความอุปถัมภ์ของพ่อท่าน แต่บัดนั้นเป็นต้นมา ซึ่งก็ได้รับอนุญาตจากกระทรวงศึกษาธิการ ให้เปลี่ยนจากชื่อเดิมมาเป็นชื่อ “บุณยลาภนฤมิต“ ได้ในปีเดียวกันมีนักเรียนเพิ่มขึ้นเป็น 320 คน มีครู 10 คน มีรถยนต์รับ - ส่งนักเรียน 1 คัน
วันที่ 12 พฤษภาคม พ.ศ. 2512 พ่อท่านคล้ายวาจาสิทธิ์ ได้ทำพิธีเจิม และเปิดป้ายชื่อโรงเรียน พร้อมทั้งมีกิจกรรมฉลองป้าย ชื่อใหม่ของโรงเรียน รวม 7 วัน 7 คืน โดยโรงเรียนจัดให้มีมหรสพหลายชนิดแสดงในงาน
ปี พ.ศ. 2516 โรงเรียนได้ย้ายสถานที่เรียนใหม่ ในที่ดิน 2 ไร่กว่า ถนนประชาวิวัฒน์ ซอย 8 มีนักเรียนเพิ่มขึ้น เป็น 560 คน มีครู 18 คน ภารโรง 1 คน มีรถยนต์รับ – ส่ง นักเรียน 3 คัน
ปี พ.ศ. 2534 โรงเรียนได้ย้ายสถานที่เรียนใหม่ ซึ่งเป็นสถานที่ตั้งโรงเรียนในปัจจุบัน ซึ่งสร้างอาคารเรียนอย่างมาตรฐาน เป็นตึก 2 ชั้น 2 หลัง มีห้องเรียน 26 ห้องเรียน มีหอประชุม และโรงอาหาร 1 หลัง ในที่ดิน 3 ไร่ครึ่ง ถนนประชาวิวัฒน์ สายโก-ลก - สุไหงปาดี ระหว่างที่ทำการไปรษณีย์ และสำนักงานการไฟฟ้าสุไหงโก-ลก
ปี พ.ศ. 2542 โรงเรียนได้สร้างอาคารประกอบ เป็นตึก 2 ชั้น 1 หลัง ซึ่งประกอบด้วย ห้องคอมพิวเตอร์ ห้องศูนย์สื่อ ห้องสมุด ห้องวิทยาศาสตร์ เพื่อใช้เป็นสถานที่สำหรับให้นักเรียนค้นคว้าเพิ่มเติม หรือทำกิจกรรมร่วมกัน ห้องละหมาด
ปี พ.ศ. 2543 โรงเรียนได้เปิดทำการสอนในระดับชั้นมัธยมศึกษาปีที่ 1 จำนวน 1 ห้องเรียน
ปี พ.ศ. 2544 โรงเรียนได้เปิดทำการสอนในระดับชั้นมัธยมศึกษาปีที่ 2 จำนวน 1 ห้องเรียน
ปี พ.ศ. 2545 โรงเรียนได้เปิดทำการสอนในระดับชั้นมัธยมศึกษาปีที่ 3 จำนวน 1 ห้องเรียน
ปี พ.ศ. 2546 มีนักเรียนระดับชั้นอนุบาลศึกษา – ชั้นมัธยมศึกษาตอนต้น รวมทั้งสิ้น 816 คน มีครู 51 คน คนงาน – ภารโรง และพนักงานขับรถรับ – ส่งนักเรียน จำนวน 18 คน มีรถรับ – ส่งนักเรียน จำนวน 8 คัน
ปี พ.ศ. 2547 เกิดเหตุการณ์ไม่สงบใน 3 จังหวัดชายแดนภาคใต้ขึ้น มีผลกระทบทำให้ผู้ปกครองจำนวนหลายคน ต้องย้ายครอบครัวไปอยู่จังหวัดอื่น จึงทำให้จำนวนของนักเรียนในโรงเรียนลดน้อยลง คือ มีนักเรียนทั้งระดับอนุบาลศึกษา – ระดับมัธยมศึกษาปีที่ 3 รวมทั้งสิ้น 731 คน มีครู 41 คน คนงาน – ภารโรง และพนักงานขับรถรับ – ส่งนักเรียน จำนวน 18 คน มีรถรับ – ส่งนักเรียน จำนวน 6 คัน
ปี พ.ศ. 2549 กรมทางหลวงชนบท ได้มีการเวนคืนที่ดิน ซึ่งทางโรงเรียนต้องทำการรื้อถอนห้องธุรการ, โรงรถ, สระว่ายน้ำด้านข้าง
ปี พ.ศ. 2550 ได้มีการทำถนนด้านหน้า – ด้านข้างโรงเรียน ทางโรงเรียนจึงต้องเช่าที่ดินด้านข้างของโรงเรียน ทำโรงรถ ในปีการศึกษา 2550 มีจำนวนนักเรียนทุกระดับชั้น รวมทั้งสิ้น 683 คน มีครู 38 คน คนงาน – ภารโรง และพนักงานขับรถรับ – ส่งนักเรียน จำนวน 18 คน และมีรถรับ – ส่งนักเรียน จำนวน 6 คัน
ปี พ.ศ. 2551-ปัจจุบัน ประมาณเดือน มกราคม 2551 สำนักบริหารงานคณะกรรมการส่งเสริมการศึกษาเอกชน (สช.) ได้กำหนดให้ทางโรงเรียนเอกชนเปลี่ยนแปลงตำแหน่งผู้บริหาร คือ " ตำแหน่งครูใหญ่ " ให้เปลี่ยนเป็น "ผู้อำนวยการโรงเรียน"